Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms