Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD3A6NKT7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms