Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERINC4A6NH21 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms