Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer3W4VSP1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer3W4VSP1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer3W4VSP1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms