Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Homer1Q9Z2Y3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Homer1Q9Z2Y3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Homer1Q9Z2Y3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Homer1Q9Z2Y3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Homer1Q9Z2Y3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Homer1Q9Z2Y3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Homer1Q9Z2Y3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Homer1Q9Z2Y3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 649.2 ms