Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn6Q9Z262 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn6Q9Z262 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cldn6Q9Z262 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn6Q9Z262 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn6Q9Z262 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn6Q9Z262 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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