Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shcbp1Q9Z179 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shcbp1Q9Z179 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shcbp1Q9Z179 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shcbp1Q9Z179 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shcbp1Q9Z179 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms