Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Katna1Q9WV86 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Katna1Q9WV86 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Katna1Q9WV86 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Katna1Q9WV86 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Katna1Q9WV86 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Katna1Q9WV86 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Katna1Q9WV86 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Katna1Q9WV86 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms