Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClcnkbQ9WUB6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClcnkbQ9WUB6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClcnkbQ9WUB6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClcnkbQ9WUB6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms