Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scnn1bQ9WU38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scnn1bQ9WU38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Scnn1bQ9WU38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scnn1bQ9WU38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scnn1bQ9WU38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms