Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc2Q9R244 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc2Q9R244 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc2Q9R244 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc2Q9R244 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc2Q9R244 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc2Q9R244 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms