Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmeff2Q9QYM9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmeff2Q9QYM9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmeff2Q9QYM9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmeff2Q9QYM9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmeff2Q9QYM9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff2Q9QYM9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms