Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copg2Q9QXK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Copg2Q9QXK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copg2Q9QXK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copg2Q9QXK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms