Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3a1Q9QX15 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca3a1Q9QX15 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clca3a1Q9QX15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca3a1Q9QX15 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca3a1Q9QX15 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clca3a1Q9QX15 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms