Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc4Q9QUQ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc4Q9QUQ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc4Q9QUQ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc4Q9QUQ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc4Q9QUQ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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