Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN7

Tlr2, Toll-like receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr2Q9QUN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr2Q9QUN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr2Q9QUN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr2Q9QUN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr2Q9QUN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr2Q9QUN7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr2Q9QUN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr2Q9QUN7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr2Q9QUN7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr2Q9QUN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr2Q9QUN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr2Q9QUN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr2Q9QUN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlr2Q9QUN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms