Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC8

Epb41l4b, Band 4.1-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4bQ9JMC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Epb41l4bQ9JMC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l4bQ9JMC8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41l4bQ9JMC8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l4bQ9JMC8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Epb41l4bQ9JMC8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l4bQ9JMC8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epb41l4bQ9JMC8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms