Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cabp5Q9JLK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp5Q9JLK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cabp5Q9JLK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp5Q9JLK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp5Q9JLK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp5Q9JLK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cabp5Q9JLK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp5Q9JLK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp5Q9JLK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp5Q9JLK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cabp5Q9JLK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cabp5Q9JLK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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