Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh9a1Q9JLJ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh9a1Q9JLJ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms