Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI6

Scly, Selenocysteine lyase, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SclyQ9JLI6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SclyQ9JLI6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SclyQ9JLI6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SclyQ9JLI6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SclyQ9JLI6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SclyQ9JLI6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms