Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nectin3Q9JLB9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nectin3Q9JLB9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nectin3Q9JLB9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nectin3Q9JLB9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nectin3Q9JLB9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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