Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc86Q9JJ89 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc86Q9JJ89 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc86Q9JJ89 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc86Q9JJ89 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc86Q9JJ89 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc86Q9JJ89 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms