Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmbr1Q9JIT0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lmbr1Q9JIT0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lmbr1Q9JIT0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmbr1Q9JIT0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms