Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim39Q9ESN2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim39Q9ESN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim39Q9ESN2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim39Q9ESN2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim39Q9ESN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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