Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a3bpQ9EQG9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a3bpQ9EQG9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col4a3bpQ9EQG9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a3bpQ9EQG9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a3bpQ9EQG9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a3bpQ9EQG9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms