Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms