Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcg8Q9DBM0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcg8Q9DBM0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcg8Q9DBM0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcg8Q9DBM0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcg8Q9DBM0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg8Q9DBM0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms