Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB76

Emc9, ER membrane protein complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc9Q9DB76 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Emc9Q9DB76 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Emc9Q9DB76 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Emc9Q9DB76 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Emc9Q9DB76 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Emc9Q9DB76 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms