Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp2aQ9DB34 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp2aQ9DB34 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp2aQ9DB34 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp2aQ9DB34 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp2aQ9DB34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2aQ9DB34 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp2aQ9DB34 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms