Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cldn22Q9D7U6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cldn22Q9D7U6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Cldn22Q9D7U6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cldn22Q9D7U6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cldn22Q9D7U6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cldn22Q9D7U6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Cldn22Q9D7U6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cldn22Q9D7U6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Cldn22Q9D7U6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,34
Cldn22Q9D7U6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Cldn22Q9D7U6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms