Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsmce1Q9D720 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce1Q9D720 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce1Q9D720 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsmce1Q9D720 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsmce1Q9D720 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms