Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec23bQ9D662 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec23bQ9D662 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec23bQ9D662 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms