Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spata1Q9D5R4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spata1Q9D5R4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spata1Q9D5R4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spata1Q9D5R4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms