Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Speer4f1Q9D5Q6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Speer4f1Q9D5Q6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Speer4f1Q9D5Q6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Speer4f1Q9D5Q6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Speer4f1Q9D5Q6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms