Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3404Q9D506 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3404Q9D506 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3404Q9D506 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3404Q9D506 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3404Q9D506 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3404Q9D506 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Gm3404Q9D506 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm3404Q9D506 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3404Q9D506 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3404Q9D506 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3404Q9D506 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3404Q9D506 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms