Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox2aQ9D4Y3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox2aQ9D4Y3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox2aQ9D4Y3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox2aQ9D4Y3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox2aQ9D4Y3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms