Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stx11Q9D3G5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx11Q9D3G5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx11Q9D3G5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx11Q9D3G5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx11Q9D3G5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms