Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmss1Q9CZT6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmss1Q9CZT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmss1Q9CZT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms