Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ7

Narf, Nuclear prelamin A recognition factor, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NarfQ9CYQ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NarfQ9CYQ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NarfQ9CYQ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NarfQ9CYQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NarfQ9CYQ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NarfQ9CYQ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NarfQ9CYQ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms