Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PmpcbQ9CXT8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PmpcbQ9CXT8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PmpcbQ9CXT8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PmpcbQ9CXT8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PmpcbQ9CXT8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms