Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snw1Q9CSN1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snw1Q9CSN1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snw1Q9CSN1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snw1Q9CSN1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms