Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msmo1Q9CRA4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msmo1Q9CRA4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msmo1Q9CRA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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