Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gadd45gip1Q9CR59 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gadd45gip1Q9CR59 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gadd45gip1Q9CR59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms