Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkn1Q9CR36 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkn1Q9CR36 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkn1Q9CR36 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkn1Q9CR36 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn1Q9CR36 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn1Q9CR36 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gkn1Q9CR36 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gkn1Q9CR36 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms