Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQF4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQF4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQF4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQF4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQF4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQF4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQF4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQF4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQF4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQF4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQF4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQF4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQF4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQF4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQF4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQF4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9CQF4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQF4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQF4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQF4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQF4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQF4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQF4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms