Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT4

Mydgf, Myeloid-derived growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MydgfQ9CPT4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MydgfQ9CPT4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MydgfQ9CPT4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MydgfQ9CPT4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MydgfQ9CPT4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MydgfQ9CPT4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MydgfQ9CPT4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MydgfQ9CPT4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MydgfQ9CPT4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MydgfQ9CPT4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MydgfQ9CPT4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms