Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bap1Q99PU7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bap1Q99PU7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bap1Q99PU7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bap1Q99PU7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Bap1Q99PU7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bap1Q99PU7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bap1Q99PU7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bap1Q99PU7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bap1Q99PU7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bap1Q99PU7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms