Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Acsbg1Q99PU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Acsbg1Q99PU5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Acsbg1Q99PU5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Acsbg1Q99PU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Acsbg1Q99PU5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Acsbg1Q99PU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Acsbg1Q99PU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Acsbg1Q99PU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Acsbg1Q99PU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Acsbg1Q99PU5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Acsbg1Q99PU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Acsbg1Q99PU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Acsbg1Q99PU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms