Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc24a3Q99PD7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc24a3Q99PD7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc24a3Q99PD7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc24a3Q99PD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc24a3Q99PD7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc24a3Q99PD7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc24a3Q99PD7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc24a3Q99PD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc24a3Q99PD7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms