Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kremen1Q99N43 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kremen1Q99N43 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kremen1Q99N43 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kremen1Q99N43 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kremen1Q99N43 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Kremen1Q99N43 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Kremen1Q99N43 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms